L'examen, en bref

Gènes étudiés

POLD1, KRAS, ERBB2, POLE, BRAF, NRAS, PIK3CA

Technique

Séquençage à haut débit NGS

Délai

15 jours maximum

Cotation

B 813 + B 1475
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Intérêt clinique

Théranostic et pronostique: dans le cancer colorectal les mutations de RAS contre-indiquent l'utilisation d'un anti-EGFR. Le variant G12C de KRAS peut permettre une inclusion dans un essai thérapeutique utilisant une thérapie ciblée. Le variant V600E de BRAF a une valeur pronostique péjorative, en particulier aux stades avancés. Sa présence confère une éligibilité à un traitement par inhibiteur de BRAF associé à un Ac anti EGFR.

Type d'organes

Que faut-il envoyer ?

Nature du prélèvement

Tissu tumoral (FFPE)

Conditions pré-analytiques

2 Micro-tubes de 2ml à fond conique (possible de vous en procurer code SAP2416) de copeaux (5 copeaux à 5µ par tube). Si < 20% de cellules tumorales les copeaux devront être réalisés après une macro-dissection réalisée par vos soins.

Température

T° Ambiante

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BIOPSIE LIQUIDE: PANEL COMPLET DONT BRAF, KRAS ET NRAS (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
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Colorectal
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Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Peau
Estomac
Pancréas
Vessie
Foie
Neuro
Poumon
Colorectal
Thyroïde
Sein
Vésicule Biliaire
MSI, INSTABILITE MICRO-SATELLITAIRE (PCR)
Technique : PCR+Analyse de fragments
Délai : 15 jours
Pancréas
Endomètre
Vésicule Biliaire
Estomac
Vessie
Foie
Colorectal
METHYLATION PROMOTEUR MLH1 (MLPA)
Technique : PCR ou MLPA
Délai : 15 jours
Vésicule Biliaire
Endomètre
Foie
Colorectal
Estomac
Pancréas
PANEL COMPLET CANCER SOMATIQUE DONT BRCA1/2 (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Foie
Peau
Endomètre
Pancréas
Ovaire
Vessie
Prostate
Neuro
Vésicule Biliaire
Poumon
Estomac
Colorectal
Thyroïde
Sein
BIOPSIE LIQUIDE: PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Estomac
Foie
Peau
Ovaire
Sein
Endomètre
Colorectal
Vésicule Biliaire
Poumon
Thyroïde
Pancréas
Vessie
Prostate
Neuro
FISH ALK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 3 jours
Vésicule Biliaire
Peau
Neuro
Estomac
Sein
Poumon
Thyroïde
Endomètre
Colorectal
Pancréas
Vessie
Foie
Ovaire
Prostate
ROS1 REARRANGEMENT
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Sein
Pancréas
Vessie
Neuro
Vésicule Biliaire
Endomètre
Ovaire
Estomac
Foie
Prostate
Thyroïde
Peau
Colorectal
HER2 (AMPLIFICATION)
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Thyroïde
Pancréas
Foie
Vessie
Vésicule Biliaire
Endomètre
Colorectal
Prostate
Poumon
Ovaire
Peau
Sein
Neuro
Estomac
FISH SUR TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Foie
Peau
Prostate
Ovaire
Thyroïde
Neuro
Colorectal
Sein
Estomac
Endomètre
Pancréas
Poumon
Vésicule Biliaire
Vessie