L'examen, en bref

Gènes étudiés

BRAF, HER2, PIK3CA, MET exon 14, EGFR, KRAS

Technique

Séquençage à haut débit NGS

Délai

15 jours maximum
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Intérêt clinique

Recherche de cible théranostique: recherche des variants de sensibilité et de résistance aux ITK ciblant l'EGFR sur la totalité des exons 18 à 21 ; KRAS G12C - éligibilité à un inhibiteur de KRAS G12C; Variant de splice sur cMET - éligibilité aux inhibiteur de MET - Variant de HER2 eligibilité aux inhibiteurs de HER2; La détection d'un variant V600E sur BRAF confère une éligibilité à un traitement par inhibiteur de BRAF. La detection d'autres variants peut faire discuter l'inclusion du ou de la patient(e) dans un essai thérapeutique adapté.

Type d'organes

Que faut-il envoyer ?

Nature du prélèvement

Tissu tumoral (FFPE)

Conditions pré-analytiques

2 tubes secs de copeaux (5 copeaux à 5µ par tube). Si < 20% de cellules tumorales les copeaux devront être réalisés après une macro-dissection réalisée par vos soins.

Température

T° Ambiante

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BIOPSIE LIQUIDE: EGFR, KRAS, BRAF, HER2, MET, STK11 ET KEAP1 (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Poumon
RECHERCHE DE FUSION ET SAUT D'EXON PAR RNASEQ: ALK/RET/ROS1/ERBB2/MET/NTRK1/2/3/NRG1/FGFR1/2/3/EGFR
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Poumon
Sein
Foie
Thyroïde
Peau
Vessie
Pancréas
Estomac
Neuro
Vésicule Biliaire
EGFR ETUDE LES EXONS 18 A 21 (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Poumon
BIOPSIE LIQUIDE: EGFR ETUDE DES EXONS 18 A 21 (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Poumon
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Délai : 5 jours
Poumon
BIOPSIE LIQUIDE: EGFR RAPIDE (42 VARIANTS/PCR)
Technique : PCR Quantitative
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Poumon
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Délai : 10 jours
Poumon
Colorectal
Thyroïde
Peau
BIOPSIE LIQUIDE: PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Foie
Sein
Poumon
Colorectal
Estomac
Vésicule Biliaire
Neuro
Prostate
Pancréas
Vessie
Ovaire
Endomètre
Peau
Thyroïde
PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Foie
Poumon
Sein
Prostate
Pancréas
Estomac
Neuro
Vésicule Biliaire
Colorectal
Thyroïde
Endomètre
Peau
Ovaire
Vessie
FISH NTRK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Poumon
Sein
Foie
Prostate
Pancréas
Vésicule Biliaire
Neuro
Estomac
Colorectal
Vessie
Ovaire
Peau
Endomètre
Thyroïde