L'examen, en bref

Gènes étudiés

Score epclin

Technique

RT-PCR en temps réel

Délai

15 jours maximum
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Intérêt clinique

Analyse d'expression multigénique pour les patientes atteintes d'un cancer du sein RE+, HER2-, à un stade précoce. Le score EPclin permet d’identifier le risque de récidive à distance avec 5 ans d’hormonothérapie adjuvante seule, ainsi que l’estimation du bénéfice absolu de la chimiothérapie.

Type d'organes

Que faut-il envoyer ?

Nature du prélèvement

Tissu tumoral (FFPE)

Conditions pré-analytiques

* Il faut OBLIGATOIREMENT indiquer la cellularité tumorale, la taille histologique de la tumeur et le nombre de ganglions envahis, indispensables pour le rendu des résultats

Un minimum de 30 % de cellules tumorales est nécessaire pour réaliser le test

* Si > 30% de cellules tumorales :

o Choisir un bloc avec la composante infiltrante la plus importante.

o Nous envoyer 2 coupes de 10µm de tissu, chacune dans un microtube de 1,5 ml étiqueté avec l’identité de la patiente (nom, prénom, date de naissance)

** Si < 30% de cellules tumorales :

o Une macrodissection est nécessaire

o Faire une sélection pour obtenir un ratio ≥ 30% puis nous envoyer 4 coupes de 10μm (2 coupes par microtube)

o Lorsque la macrodissection n’est pas réalisée par vos soins, nous envoyer 5 lames blanches de 10 µm avec cerclage de la zone d’intérêt à macrodisséquer.

Température

T° Ambiante

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RECHERCHE DE FUSION ET SAUT D'EXON PAR RNASEQ: ALK/RET/ROS1/ERBB2/MET/NTRK1/2/3/NRG1/FGFR1/2/3/EGFR
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Foie
Poumon
Sein
Pancréas
Estomac
Vésicule Biliaire
Neuro
Vessie
Colorectal
Thyroïde
Peau
BRCA1 ET BRCA2 SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Sein
Pancréas
Prostate
BIOPSIE LIQUIDE: BRCA1 ET BRCA2 SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Sein
Pancréas
Ovaire
Prostate
PIK3CA (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Sein
BIOPSIE LIQUIDE: PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Foie
Poumon
Sein
Pancréas
Vésicule Biliaire
Estomac
Neuro
Prostate
Vessie
Colorectal
Endomètre
Peau
Ovaire
Thyroïde
PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Foie
Pancréas
Sein
Poumon
Endomètre
Peau
Ovaire
Thyroïde
Prostate
Vésicule Biliaire
Estomac
Neuro
Colorectal
Vessie
FISH NTRK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Foie
Pancréas
Sein
Poumon
Vessie
Prostate
Vésicule Biliaire
Estomac
Neuro
Peau
Endomètre
Ovaire
Thyroïde
ROS1 REARRANGEMENT
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Foie
Sein
Pancréas
Endomètre
Peau
Ovaire
Thyroïde
Vessie
Colorectal
Vésicule Biliaire
Estomac
Neuro
Prostate
HER2 (AMPLIFICATION)
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Foie
Poumon
Sein
Pancréas
Ovaire
Endomètre
Peau
Thyroïde
Prostate
Neuro
Estomac
Vésicule Biliaire
Vessie
Colorectal
FISH ALK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 3 jours
Foie
Pancréas
Poumon
Sein
Peau
Endomètre
Ovaire
Thyroïde
Vessie
Colorectal
Vésicule Biliaire
Estomac
Neuro
Prostate