L'examen, en bref

Gènes étudiés

IDH2, IDH1

Technique

Séquençage à haut débit NGS

Délai

15 jours maximum
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Intérêt clinique

Théranostic: les variants de l'exon 4 d'IDH1/2 sont ciblables par des inhibiteurs spécifiques dont la disponibilité est à discuter en fonction du variant ainsi que de la pathologie.

Que faut-il envoyer ?

Nature du prélèvement

Tissu tumoral (FFPE)

Conditions pré-analytiques

2 tubes secs de copeaux (5 copeaux à 5µ par tube). Si < 20% de cellules tumorales les copeaux devront être réalisés après une macro-dissection réalisée par vos soins.

Température

T° Ambiante

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RECHERCHE DE FUSION ET SAUT D'EXON PAR RNASEQ: ALK/RET/ROS1/ERBB2/MET/NTRK1/2/3/NRG1/FGFR1/2/3/EGFR
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Poumon
Sein
Foie
Thyroïde
Peau
Vessie
Pancréas
Estomac
Neuro
Vésicule Biliaire
Colorectal
BRAF, MUTATION V600E (PCR DIGITALE)
Technique : PCR Digitale
Délai : 10 jours
Colorectal
Neuro
Thyroïde
Peau
MSI, INSTABILITE MICRO-SATELLITAIRE (PCR)
Technique : PCR+Analyse de fragments
Délai : 15 jours
Foie
Estomac
Vésicule Biliaire
Colorectal
Endomètre
Vessie
BIOPSIE LIQUIDE: PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Foie
Poumon
Sein
Colorectal
Estomac
Vésicule Biliaire
Neuro
Prostate
Pancréas
Vessie
Ovaire
Endomètre
Peau
Thyroïde
PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Foie
Poumon
Sein
Prostate
Pancréas
Estomac
Neuro
Vésicule Biliaire
Colorectal
Thyroïde
Peau
Endomètre
Ovaire
Vessie
FISH NTRK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Poumon
Sein
Foie
Prostate
Pancréas
Vésicule Biliaire
Neuro
Estomac
Vessie
Ovaire
Peau
Endomètre
Thyroïde
ROS1 REARRANGEMENT
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Sein
Foie
Pancréas
Prostate
Vésicule Biliaire
Neuro
Estomac
Colorectal
Endomètre
Peau
Vessie
Ovaire
Thyroïde
HER2 (AMPLICATION)
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Sein
Poumon
Foie
Pancréas
Prostate
Colorectal
Estomac
Neuro
Vésicule Biliaire
Ovaire
Vessie
Endomètre
Peau
Thyroïde
FISH ALK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 3 jours
Foie
Sein
Thyroïde
Vessie
Ovaire
Endomètre
Peau
Pancréas
Prostate
Estomac
Vésicule Biliaire
Neuro
Colorectal
FISH SUR TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Foie
Sein
Poumon
Ovaire
Vessie
Endomètre
Peau
Thyroïde
Vésicule Biliaire
Neuro
Estomac
Colorectal
Prostate
Pancréas