L'examen, en bref

Gènes étudiés

FGFR2, HRAS, CDK4, FGFR1, H3C2, MET, CDK6, POLE, PTEN, BRAF, IDH2, KRAS, TERT, H3F3A, ATRX, CDKN2A, H3F3B, TP53, FGFR3, IDH1, PIK3CA, EGFR, MAP2K1, PDGFRA, NRAS, H3C3, RB1

Technique

Séquençage à haut débit NGS

Délai

15 jours maximum
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Type d'organes

Que faut-il envoyer ?

Nature du prélèvement

Tissu tumoral (FFPE)

Conditions pré-analytiques

2 tMicro-tubes de 2ml à fond conique (possible de vous en procurer code SAP2416) de copeaux (5 copeaux à 5µ par tube). Si < 20% de cellules tumorales les copeaux devront être réalisés après une macro-dissection réalisée par vos soins.

Température

T° Ambiante

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RECHERCHE DE FUSION ET SAUT D'EXON PAR RNASEQ: ALK/RET/ROS1/ERBB2/MET/NTRK1/2/3/NRG1/FGFR1/2/3/EGFR
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Foie
Vésicule Biliaire
Poumon
Estomac
Vessie
Peau
Thyroïde
Colorectal
Pancréas
Neuro
Sein
ETUDE GÉNOMIQUE PAR SHALLOW WHOLE GENOME
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Poumon
Neuro
METHYLATION PROMOTEUR MGMT
Technique : PCR ou MLPA
Délai : 15 jours
Neuro
PANEL COMPLET CANCER SOMATIQUE DONT BRCA1/2 (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Vessie
Colorectal
Ovaire
Peau
Estomac
Neuro
Pancréas
Endomètre
Vésicule Biliaire
Thyroïde
Sein
Foie
Prostate
Poumon
BIOPSIE LIQUIDE: PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Thyroïde
Prostate
Vessie
Poumon
Colorectal
Sein
Foie
Ovaire
Vésicule Biliaire
Neuro
Estomac
Pancréas
Endomètre
Peau
FISH ALK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 3 jours
Thyroïde
Endomètre
Colorectal
Prostate
Sein
Estomac
Poumon
Neuro
Foie
Peau
Vésicule Biliaire
Pancréas
Vessie
Ovaire
ROS1 REARRANGEMENT
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Vésicule Biliaire
Endomètre
Vessie
Estomac
Prostate
Peau
Foie
Ovaire
Neuro
Pancréas
Colorectal
Sein
Thyroïde
HER2 (AMPLIFICATION)
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Thyroïde
Ovaire
Sein
Colorectal
Peau
Foie
Vessie
Estomac
Poumon
Prostate
Endomètre
Neuro
Pancréas
Vésicule Biliaire
FISH SUR TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Prostate
Sein
Vésicule Biliaire
Foie
Pancréas
Colorectal
Vessie
Poumon
Estomac
Peau
Neuro
Endomètre
Ovaire
Thyroïde
FISH NTRK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Ovaire
Prostate
Endomètre
Neuro
Estomac
Sein
Thyroïde
Peau
Foie
Poumon
Vessie
Vésicule Biliaire
Pancréas