L'examen, en bref

Gènes étudiés

H3C3, IDH1, TERT, RB1, CDKN2A, PIK3CA, FGFR2, FGFR1, BRAF, EGFR, TP53, H3C2, PDGFRA, CDK6, ATRX, IDH2, MAP2K1, POLE, KRAS, H3F3B, H3F3A, PTEN, FGFR3, MET, CDK4, HRAS, NRAS

Technique

Séquençage à haut débit NGS

Délai

15 jours maximum
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Type d'organes

Que faut-il envoyer ?

Nature du prélèvement

Tissu tumoral (FFPE)

Conditions pré-analytiques

2 tMicro-tubes de 2ml à fond conique (possible de vous en procurer code SAP2416) de copeaux (5 copeaux à 5µ par tube). Si < 20% de cellules tumorales les copeaux devront être réalisés après une macro-dissection réalisée par vos soins.

Température

T° Ambiante

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RECHERCHE DE FUSION ET SAUT D'EXON PAR RNASEQ: ALK/RET/ROS1/ERBB2/MET/NTRK1/2/3/NRG1/FGFR1/2/3/EGFR
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Pancréas
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Thyroïde
Foie
Estomac
Sein
Vessie
Peau
Vésicule Biliaire
Neuro
Colorectal
ETUDE GÉNOMIQUE PAR SHALLOW WHOLE GENOME
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Neuro
Poumon
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Délai : 15 jours
Neuro
PANEL COMPLET CANCER SOMATIQUE DONT BRCA1/2 (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Poumon
Ovaire
Neuro
Estomac
Endomètre
Colorectal
Peau
Sein
Vessie
Foie
Pancréas
Prostate
Vésicule Biliaire
Thyroïde
BIOPSIE LIQUIDE: PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Colorectal
Sein
Pancréas
Estomac
Endomètre
Vésicule Biliaire
Ovaire
Poumon
Thyroïde
Foie
Prostate
Neuro
Vessie
Peau
FISH ALK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 3 jours
Thyroïde
Vessie
Estomac
Poumon
Neuro
Endomètre
Prostate
Ovaire
Foie
Peau
Sein
Pancréas
Vésicule Biliaire
Colorectal
ROS1 REARRANGEMENT
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Ovaire
Sein
Prostate
Thyroïde
Vessie
Colorectal
Neuro
Peau
Endomètre
Estomac
Vésicule Biliaire
Pancréas
Foie
HER2 (AMPLIFICATION)
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Vessie
Pancréas
Endomètre
Colorectal
Vésicule Biliaire
Foie
Neuro
Peau
Estomac
Sein
Prostate
Ovaire
Thyroïde
Poumon
FISH SUR TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Pancréas
Neuro
Endomètre
Peau
Poumon
Colorectal
Ovaire
Estomac
Foie
Thyroïde
Prostate
Vessie
Sein
Vésicule Biliaire
FISH NTRK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Vessie
Peau
Prostate
Neuro
Sein
Estomac
Poumon
Thyroïde
Endomètre
Foie
Vésicule Biliaire
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Pancréas