L'examen, en bref

Gènes étudiés

EGFR, H3C3, MET, PTEN, PIK3CA, IDH1, ATRX, IDH2, POLE, TP53, H3F3B, CDK6, H3C2, FGFR2, NRAS, RB1, TERT, CDKN2A, BRAF, HRAS, CDK4, FGFR3, KRAS, FGFR1, H3F3A, PDGFRA, MAP2K1

Technique

Séquençage à haut débit NGS

Délai

15 jours maximum
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Type d'organes

Que faut-il envoyer ?

Nature du prélèvement

Tissu tumoral (FFPE)

Conditions pré-analytiques

2 tMicro-tubes de 2ml à fond conique (possible de vous en procurer code SAP2416) de copeaux (5 copeaux à 5µ par tube). Si < 20% de cellules tumorales les copeaux devront être réalisés après une macro-dissection réalisée par vos soins.

Température

T° Ambiante

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RECHERCHE DE FUSION ET SAUT D'EXON PAR RNASEQ: ALK/RET/ROS1/ERBB2/MET/NTRK1/2/3/NRG1/FGFR1/2/3/EGFR
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Estomac
Vésicule Biliaire
Foie
Vessie
Sein
Pancréas
Neuro
Poumon
Peau
Colorectal
Thyroïde
ETUDE GÉNOMIQUE PAR SHALLOW WHOLE GENOME
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Neuro
Poumon
METHYLATION PROMOTEUR MGMT
Technique : PCR ou MLPA
Délai : 15 jours
Neuro
PANEL COMPLET CANCER SOMATIQUE DONT BRCA1/2 (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Pancréas
Foie
Estomac
Neuro
Colorectal
Prostate
Thyroïde
Poumon
Endomètre
Peau
Sein
Vessie
Ovaire
Vésicule Biliaire
BIOPSIE LIQUIDE: PANEL CANCER SOMATIQUE (NGS)
Technique : Séquençage à haut débit NGS
Délai : 15 jours
Neuro
Vessie
Peau
Thyroïde
Colorectal
Ovaire
Endomètre
Sein
Poumon
Pancréas
Vésicule Biliaire
Estomac
Foie
Prostate
FISH ALK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 3 jours
Vésicule Biliaire
Pancréas
Foie
Vessie
Peau
Endomètre
Prostate
Neuro
Sein
Colorectal
Thyroïde
Ovaire
Estomac
Poumon
ROS1 REARRANGEMENT
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Vessie
Sein
Ovaire
Neuro
Thyroïde
Prostate
Peau
Colorectal
Foie
Vésicule Biliaire
Endomètre
Estomac
Pancréas
HER2 (AMPLIFICATION)
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Sein
Vésicule Biliaire
Peau
Colorectal
Poumon
Prostate
Neuro
Foie
Vessie
Pancréas
Estomac
Ovaire
Endomètre
Thyroïde
FISH SUR TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Neuro
Foie
Ovaire
Endomètre
Sein
Peau
Poumon
Pancréas
Vessie
Prostate
Estomac
Vésicule Biliaire
Colorectal
Thyroïde
FISH NTRK SUR BLOC DE TISSU TUMORAL INCLUS EN PARAFFINE
Technique : FISH
Délai : 7 jours
Vessie
Poumon
Neuro
Endomètre
Sein
Estomac
Pancréas
Vésicule Biliaire
Thyroïde
Ovaire
Foie
Peau
Prostate